Z dniem 21 grudnia 2017 r. weszło w życie rozporządzenie Ministra Środowiska z dnia 13 grudnia 2017 r. w sprawie trybu działania organów wojewódzkich funduszy ochrony środowiska i gospodarki wodnej (Dz.U. z 2017 r. poz. 2386).

Rozporządzenie określa szczegółowy tryb działania organów wojewódzkich funduszy oraz sposób udzielania pełnomocnictw. Tym samym utracił moc Statut WFOŚiGW w Krakowie nadany uchwałą Nr XXXVII/561/17 Sejmiku Województwa Małopolskiego z dnia 19 czerwca 2017 r. (Dz.Urz.Woj. Małopol. poz. 4659), który był dotychczasową podstawą prawną określającą szczegóły działalności organów Funduszy.